국민권익위원회가 발표한 “2009년도 공공기관 청렴도 측정결과”에 따르면 인천항만공사가 9.11점을 얻어 3년 연속 청렴도 우수기관에 포함되었다. 이번 조사는 중앙행정기관과 시도 및 지역교육청, 공직유관기관 등 478개 기관을 대상으로 국민권익위원회가 주관이 되어 부패발생소지가 높은 업무를 측정대상으로 전화면접을 실시한 결과, 인천항만공사는 2007년 처음 청렴도평가를 시작한 이후 계속 우수기관에 포함되는 결과를 얻었다.